Puedes tener dual channel tanto si pones los dos módulos en las ranuras negras como si pones los dos en las azules. ¿También tienes problemas para poner los módulos en las ranuras azules con ese disipador?
Yo intentaría activar el dual channel ya que, aunque en muchos casos no hay gran diferencia entre single y dual en lo que se refiere al rendimiento de la CPU, sí que afecta bastante al rendimiento de la gráfica integrada.
Ten en cuenta que tu sistema une la potencia tanto de la gráfica integrada como de la tarjeta gráfica, y la primera utiliza la RAM de la placa base para funcionar, y la mitad de ancho de banda para la memoria puede perjudicar mucho su rendimiento.
Incluso, si la parte superior del disipador de los módulos no es muy rígida, quizá puedas doblar un poco los salientes para rebajar la altura y que te encajen bien debajo del disipador.
Sobre la temperatura de la CPU, solo algunos compuestos térmicos mejoran su rendimiento tras algunas horas de uso. Por ejemplo, una de las más populares, la Arctic Silver 5. No estoy seguro de que sea el caso de la Arctic Cooling MX-4.
Eso si, es importante asegurarse de no haber puesto demasiada cantidad ya que eso puede ser contraproducente. Teniendo bien limpias las superficies de contacto del disipador y del procesador, se pone una capa muy fina de pasta que cubra uniformemente el procesador y ya está.
También hay gente que pone una gota de pasta en el centro del procesador (quizá del tamaño de un guisante) y, al colocar el disipador, queda esparcida por la superficie del procesador debido a la presión que se realiza para encajar el disipador.