Por curiosidad,
@DeBilbao, dado que mantengo el disco principal, sería lo mismo hacer esto?
. Instalar el SSD
. Descargar OS Sierra, y cuando pregunta a qué disco instalar, indicar al SSD
. Arrancar con tecla Alt desde el SSD
. Restaurar datos y apps desde disco con la copia de TimeMachine
Manteniendo el disco puedes hacerlo así, te ahorras el USB booteable, además en el primer arranque de Sierra puedes restaurar los datos desde el disco principal en lugar de la copia, será más rápido al estar en local.
Haz la migración de datos en el primer arranque importando los usuarios, si llegas a crear un usuario nuevo luego puedes tener problemas de permisos.
No me queda claro cual quedará seleccionado como disco de arranque, si resulta ser el antiguo puedes cambiarlo desde preferencias del sistema.